当使用透析袋时，透析通常可以通过使用特殊的半透膜来完成。半透膜可制成袋状，将生物大分子样品溶液倒入袋中，然后将透析袋浸入水或缓冲溶液中。样品溶液中分子量较大的生物分子被截留在袋中，而盐和小分子物质不断扩散并从袋中透析出来，直到袋内外的浓度达到平衡。保留在透析袋中且未透析出的样品溶液称为“滞留物”，袋(膜)外的溶液称为“渗出物”或“透析液”。透析的动力是扩散压力，它是由穿过膜的浓度梯度形成的。透析速度与膜的厚度成反比，与膜两侧待透析的小分子溶质的浓度梯度成正比，也与膜的面积和温度成正比。透析通常在4度进行。提高温度可以加快透析速度。