正常情况下，由透析袋净化的样品将被稀释。如果下游要求的样品浓度相对较高，可能需要对样品进行浓缩。透析袋本身的浓缩方法如下。
吹干浓缩法：将蛋白质溶液放入分析袋中，用电风扇吹干。该方法简单但缓慢，温度不宜过高，最好不超过15度。
分析袋浓缩法：用分析袋浓缩蛋白质溶液是最广泛使用的方法。将待浓缩的蛋白质溶液放入透析袋中(没有一个透析袋可以用玻璃纸代替)，并加入聚合物(6000-12000)，如聚乙二醇(碳蜡)、聚乙烯吡咯、烷酮等。或者将蔗糖喷洒在透析袋外面。吸水剂还可以制成浓度为30%-40%的溶液，可以放入装有蛋白质溶液的透析袋。使用后，吸水剂可以放入保温箱中烘干，也可以自然烘干后重复使用。主要用于替代蛋白质的缓冲液必须有透析袋。不需要特殊的仪器。实验一般采用聚乙二醇20000，简单、快速，对蛋白质无影响。
此外，还有其他样品浓缩方法，如冷冻干燥浓缩法、超滤膜浓缩法等。