生态农业是以生态学理论为主导，运用系统工程方法，以合理利用农业自然资源和保护良好的生态环境为前提，将传统农业的经验和现代农业的科技进行有机的结合，因地制宜地规划组织和进行生产的现代农业。随着资源短缺和环境污染问题的不断加剧，世界各国生态农业的发展规模正在不断扩大，已经成为当今农业发展的基本方向。贵阳市要建设生态文明城市，大力发展生态农业是其必然的选择，也是建立生态文明城市的最基础、最关键的工作，同时也是实现贵阳市农业可持续发展的客观要求。在市委、市政府的领导下，经过广大科技工作者与广大农村干部和农民群众的共同努力，近几年来，贵阳市生态农业有较大的发展，并取得了显著的成效。使我市农业和农村的发展保持着良好的发展势头，初步形成了一些具有地方特色的发展生态农业的运作模式，其主要有以下十种：
一、以建沼气池为基础的农业生态种养模式。也可简称为“四改一气种养”模式。为了发展农村的循环经济，我市围绕农村节能减排，大力发展以建沼气池为纽带的配套改圈、改厕、改厨、改路及沼液、沼渣在种植业、养殖业上的推广利用工作，简称为“四改一气一种一养”农村生态能源建设工作。沼气池的建设和使用大大改善了农村的生产、生活条件。目前，全市已建沼气池达20万口以上。我市开展“四改一气种养”较好的开阳县，在2000年至2007年全县共建设户用小型高效沼气池60698口，结合沼气池的建设改圈并投入使用59553间，改厕并投入使用60271座，改厨（改灶台）并投入使用47963户，改建串寨硬化的路并投入使用225公里。沼气池的大力推广利用，不仅使农民用了清洁、卫生的能源，他们用沼气做饭、炒菜、点灯、取暖，减少了对山林的砍伐，有效的保护了森林，降低了农民购买煤、柴的费用，还促进了农业资源的循环利用，他们用沼肥追施小麦、玉米、油菜、烤烟、果树、用沼液浸种、喷施各种农作物，还用沼液养猪、养鱼。涌现了一批猪一沼一粮，猪一沼一果，猪一沼一菜，猪一沼一烟（烤烟）等循环经济模式，促进了养殖业、种植业的大力发展。“四改一气一种一养”生态能源建设项目的广泛实施，夯实了我市发展现代生态农业的基础。
二、农业综合开发经营模式，即是以公司为龙头企业，以农民为产业工人，以建立商品生产基地为依托，面向市场生产、实现公司、农户双赢的经营模式。清镇市大发养殖有限公司被贵阳市政府和省政府认定的农业产业化龙头企业，该公司从2005年通过招商引资进驻清镇市，该公司以农户鸡舍为生产车间，以农民为肉鸡产业化生产工人，专门带动农户发展规模化肉鸡饲养的大型龙头企业。该公司吸取过去“订单农业”包收购而不定回收价，农民利益得不到保障的教训，采取“四提供—回收—确保”的模式，发展肉鸡生产。公司以记帐的形式向养鸡农户提供鸡苗、饲料、药品和技术管理一条龙服务，保价回收农户饲养的肉鸡，在生产指标正常的情况下，确保农户每只肉鸡利润在1.5元以上。大发公司把自身的技术优势（有中高级畜牧技术人员23人），资金优势（有资产3000万元）市场优势带给农户，不仅解决了农户养鸡资金投入不足和技术缺乏的困难，而且也解决了农户成鸡销售渠道不畅和抵御市场风险脆弱的问题，农户只需利用场地自建鸡舍，购买生产用具和投劳养鸡。公司因此减少鸡舍修建和生产用具的投入，减少雇用养鸡员工的成本，把公司和农户的资源优势进行整合和互补，实现经济效益的双赢。2007年该公司已带动清镇市红枫湖镇和百花湖乡的农户1355户养鸡，全年出栏合格肉鸡580万只，平均成活率97.19%，平均料肉比2.67:1，农户平均每只鸡获利2.16元，养鸡农户增收1250万元，户均增收9230元。农户通过参与大发公司养肉鸡增收十分明显。鸡粪又是优质有机肥，农户除自用外，还向外卖鸡粪增加收入。整个生产流程形成专业化生产、规模化发展、企业化管理、市场化运作的产业生态经营模式。
三、农产品基地集约高质高效安全生产模式。贵阳裕东农业发展有限公司是通过粤黔合作引进香港裕东农业有限公司进驻在清镇市红枫湖镇和暗流乡建立的蔬菜进超市的生产基地。该公司通过向218户农民租用600亩土地，建立蔬菜种植示范基地，返聘农民为农场工人，每个农民工全勤月收入约900-1200元，土地每亩租金600元，该公司对农民进行种植、采收、标准等专题培训，培训达1450人次。裕东公司运用美国亚联微生物土壤改良剂在基地使用，可以减少化肥施用，减少土壤中氮、磷的含量，降解土壤重金属，减少农业面源污染，增加农产品产量，提高产品档次，也保护了贵阳的饮水资源。由于该公司种植的蔬菜品质相当好，维生素C最高达134mg/100g，是国家标准的4倍，糖度最高达9度，是广东地区同品种的3倍，经世界500强之一的沃尔玛公司直接考察认定，为沃尔玛首个蔬菜直接采购基地，产品直送广东超市和西南地区17家超市。裕东公司采取“市场+标准+技术+管理+环保+保险+基地+公司+农户+政府重点扶持”的模式，除核心示范基地600亩外，还带动周边村无公害蔬菜种植10000亩，从而实现蔬菜产业化、标准化、规模化、企业化、市场化，为清镇市蔬菜产品走出省门，走出国门，参与国际市场竞争提供平台。
四、植物生态产业链模式。金花石蒜是我市野生的植物资源，其花茎挺拨，花色艳丽，具有极高的观赏价值，被西方人誉为“魔术花”“中国郁金香”，可以作切花、盆花、地被花，而金花石蒜的球茎还可以提取价格昂贵的特效药加兰他敏（用于治疗老年痴呆症）和石蒜碱，加工提炼后的残渣，还可以加工成乙醇等生物燃料，加工乙醇后的酒渣又可加工成有机饲料，供养殖用。贵州芊芊园艺新技术发展公司就在乌当区东风镇的麦穰村和百宜乡租农民的荒山荒地种植金花石蒜，每亩可获得3000元的年纯收入，加上返聘农民做工的工资，农户每人年均收入达1.2万余元；2007年该项就实现产值500万元，带动农民增收100万元，目前，金花石蒜的花球和切花，已走向国内外市场，出口到日本、荷兰等国家，在公司的带领下，金花石蒜的栽培正随着“链式开发，循环利用”助农民增收的绿色发展之路前进。
五、小流域综合治理模式。我市母亲河——南明河上游松柏山、花溪、阿哈三座大水库，是全市人民饮水的主要保障，也是发展我市农业的重要命脉，为了确保水库的安全，花溪区在水库的部分流域开展以保持水土为基础的实行工程措施和生物措施相结合的综合治理，减少了水土沙石流失而对水库的侵害，也为农民增产增收创造了条件。如处于松柏山水库旁的党武乡的松柏小流域治理工程，从2003年11月开工，到2004年4月完成，共投资214万元，治理流域面积21.4平方公里，其中用筑石坎进行坡改梯土33.3公顷，营造经果林（以金秋梨为主）6.7公顷，铺筑耕作道3公里，修500立方米的蓄水池20口和相应的农灌渠6公里，营造水土保持林676.2公顷，实现封禁治理1304.4公顷，从而防止水土流失，缓解了当地旱涝灾害，确保农业的稳产高产。
六、林、果、茶、药、菜立体生态模式。就是利用农作物和林、果之间的生长时的时空差异和互补关系，在林果株行距中的开阔地种植蔬菜、药材等经济作物或林果下养殖鸡鸭的复合种养的立体生态模式。这种既能提高土地利用率，增加经济效益，又能保护土壤，减少水土流失，减少病虫害。如开阳的青禾乡利用地势高差，在山顶发展一万亩富硒菜园，在山腰发展万亩果园，在山脚的坝地发展万亩菜花园，在盆地的周围形成一幅立体农业的布局，既因地制宜地发展了农业生产，也为春夏的旅游增添艳丽的山乡景色。清镇市麦格乡利用山地垂直差异较大和土壤类型复合分布，适应多种中药材生长的自然资源优势，引进贵州恒霸、贵州神奇、贵州汉方等一批药企，用工业化的理念谋划中药材基地种植，使该乡发展中药材种植面积8000余亩，已实现中药材产值500多万元。近三年将继续扩建使木本中药材种植达一万亩，草本中药材达5000亩，成为贵阳市中药材仿野生种植示范基地成为贵阳的“药谷”。
七、废弃物资源综合利用模式。发展养殖业的牛粪、猪粪、鸡粪等废弃物，除作为沼气池的主料发酵产生沼气外，有的还可以利用生物，微生物工艺措施，产生多种产品增加经济效益，后进行无害化处理，再返回农田果园作肥料，达到废弃资源的充分利用，环境保护、土壤改良的目的，贵州大兴农业科技发展公司，在乌当区新场乡建有上千头的奶牛基地，他们利用牛粪养殖蚯蚓，已建养蚯蚓池上千平方米。养出的蚯蚓又作药用原料，卖给有关药业厂家，作美容和治男性病的药原料，蚯蚓干又可当作蛋白饲料作养鸡、养鱼用。另一部分牛粪可晒干作种食用菌的基料，可卖到一元钱一斤。这种废弃物的综合利用既达到生态的循环利用又提高了经济效益。
八、废弃矿山植被恢复生态模式。我市郊县蕴藏着丰富的铝、铁、煤等矿产资源，但过去开采矿后，往往要破坏一些原始植被，并留下大批的废渣，容易造成水土流失吞食耕地和环境的污染，造成对农业生态的破坏。近几年来，在国家强制关停小煤窑小矿山后，在政府的引导下，一些原来的矿山老板和有识之士，也纷纷加入治理废弃矿山的工作，他们在废弃矿山上植树造林，种草，采取一些工程措施，修整了道路和渠道，使废弃矿山的生态逐年好转，有的还成为新的农家乐旅游场所。清镇市有废弃矿山7400多亩，其中站街的1400多亩，已治理达到林果郁闭的生态恢复。
九、乡村清洁工程模式。乡村清洁工程，包括农业生产清洁工程，农村生活环境净化工程，农民生态文明意识提升工程三个组成部分。农业生产清洁工程就是重点解决农业投入物品施用、牲畜粪便造成的污染问题，首先要完善农业生产基础设施，疏导沟渠，修建农业投入品废弃物收集池，并定期由专人收集分类处理，修建排水暗沟，将畜禽粪便输送到沼气池产生沼气供农户作生活燃料，沼液和沼渣作有机肥使用，农户的生活污水经封闭式管道进入三级净化池，对分离处理后的废水，作灌溉用水或达标排放，安放太阳能频振杀虫灯，诱杀害虫蚊蝇。推广生态施肥技术，实施测土配方施肥。农村生活环境净化工程，主要是以户或农户集中区修污水净化池，硬化农户串户路面和沟渠，铺设排污管，铺设清洁饮水管道，实施庭院、道路绿化，对人畜粪便和生活污水分类处理，对生活垃圾分类回收，分类处理，禁止乱丢乱倒，要配备不同颜色的垃圾桶，分别收集可降解（指剩饭菜和瓜果皮等）生物性垃圾进堆沤地处理。可回收（指纸类、塑料、橡胶、玻璃、金属和织物等）垃圾集中回收处理，其它垃圾（指各类瓶罐物品，灰土、砖瓦、陶器等）采取集中填埋处理，农民生态文明意识提升主要是通过宣传教育、技能培训、提高农民的生态文明意识，养成自觉文明行为，在示范区要推行经济补助的激励政策，逐步实现农村生态文明管理物业化、专业化，要建立乡村清洁工程示范村村民卫生公约，并签订卫生责任状，并通过强化培训，增强生态意识，定期开展创优争先活动，使农民逐步走上生产发展、生活富裕、生态良好的文明发展道路。这项工程花溪区已在湖潮乡的冷饭河村，久安乡的雪厂村和青岩镇的摆早村和开阳县在龙广村平寨进行示范村试点，已初见成效。开阳县南江乡龙广村平寨结合发展乡村旅游业和现代农业示范点建设，安装振频式杀虫灯20盏,建田间蓄粪池50口,建回收池20个,建沼气池40口,生活污水处理池9口,铺设污水管道2800米,配公共生活垃圾箱15个,垃圾运输车一辆,硬化村寨和串户路2000米,修排水沟1500米,建庭院式花坛400平方米,建公厕一座,建洗澡间20间,多数农民用上太阳能热水器,秸杆气化炉,沼气等清洁能源。小河区在金山村，在实施乡村清洁工程时，在一个自然村寨集中建一个人工湿地的污水处理示范工程，该湿地有一亩，利用水生挺生植物的吸污分解特性对170多户农户的生活污水集中进行生物自然处理，经过人工湿地生物处理后的水，可达到饮用水的水平，才重新排入阿哈湖。解决了农民生活污水可能造成对湖水的污染问题。
十、退耕还林、封山育林、维护天然林，形成环城林带模式。我市属喀斯特地貌，陆生生态系统十分脆弱，一旦造成水土流失就难以恢复，严重的还会造成石漠化。因此，森林是贵阳市重要的生态屏障，不仅造成宜居的良好生态环境，也是农业生产获得稳产和可持续发展的生态保障。因此我们必须采取多种措施加以保护，将25度以上的坡耕地退耕还林，就是重要的一环，从2000年开始，我市陆续在市郊县全面开展退林还林工作，共完成退耕还林工程建设54.6万亩，其中退耕造林25.6万亩，在退耕还林中将种植水保生态林和经果林结合起来。实行荒山造林29万亩，对一些原有的天然生态林进行管护，对一些山头实行封山育林，经过多年的不断努力，加上原有的国营林场和几个森林公园，使全市的森林覆盖率上升到现在的34.77%，森林面积达289.4万亩，形成两条环绕贵阳市区的森林带，成为安置在贵阳旁边的巨大水库和天然氧吧，据有关部门2007年的统计数据显示，贵阳市环城林带每年可蓄水32303.8万吨，保土8398.9万吨，吸收二氧化硫7.8万吨，吸收二氧化氮3.9万吨，吸收一氧化碳24.6万吨，吸收二氧化碳3938.7万吨，释放氧气2870.6万吨，吸收尘埃732.6万吨，其生态效益在今后10年内最低可以达到10.158亿元。由于造林护林工作卓有成效，贵阳市三次获得“全国绿化先进单位”“全国园林绿化先进单位”“国家级森林城市”和“中国避暑之都”的光荣称号。贵阳市良好的林业生态和冬暖夏凉的气候，已成为贵阳可资依托的最大的后发优势，贵阳市的生态优势正逐步转变成经济优势。
贵阳市发展生态农业的这十种主要模式，不是全部模式的概括，只是其中主要的代表部分，但通过这十种主要模式，我们基本可以看出贵阳市发展生态农业的主要特点有以下几点：
一、农业生态产业循环链在逐步延长，贵阳市在生态农业产业发展规划中，将对生猪、奶牛、蛋禽、花卉、果树、中药、高品质绿茶、桑蚕八大生态农业产业予以倾斜扶持，把这八大生态农业产业做大做强，并不断延长其产业循环链，是一项系统工程，每一个产业的产前、产中、产后都牵涉到多学科、多部门需要多方面的紧密协调配合。如以饲养生猪为基础形成的猪一沼一菜（果）等循环生态链和牛粪综合利用的生态链等，在我市已初具规模，产生了良好的效益。金花石蒜生态产业链的开发利用在不断的延长。我们要按照自然规律和经济规律办事，不断地把产业循环链延长，才能不断增加其经济效益和生态效益，充分发展资源的作用。
二、龙头企业的带动作用在不断增强。农业产业化的龙头企业在发展生态农业中的模范带动作用日趋显著，他们利用自身在技术、资金、管理上的优势和农民的土地资源和劳力优势结合起来。无论是采取土地反租倒包形式还是专业生产服务形式，使我市的商品生产基地的发展，不断巩固和发展，不仅扩大了商品生产，不断满足和丰富了市场的需求，还带动了一方农民增收致富，也提高了农民进行规模化、科学化种养的新技术。形成发展农业产业化需要龙头企业的带动才发展得又快又好，而农民在龙头企业的带动下，商品生产才规模化，并较快的劳动致富，而企业依托农民也才不断的发展壮大，从而形成双赢的良好局面。
三、产业化的专业技术服务队伍在不断发展壮大。沼气池的修建和管护是一项专业技术性强和必须安全使用否则危险性较大的生态能源建设工作。为了确保沼气池的建设质量和使用的安全规范，我市曾多次组织相关技术人员进行技术培训，培训的内容主要有沼气池的安全施工、使用、管护以及沼气、沼液、沼渣的综合利用等，参加培训的技工通过笔试和实际操作合格后才颁发技术合格证和上岗证，取得上岗证的技工按乡镇的任务比例分配下去施工和服务，开阳县在2004年就组织由沼气池维修技工组成“开阳县沼气协会”，逐步发展壮大，同时在全县16个乡镇108个村设置沼气维修服务点，平时坚持走村串寨搞普查，指导农户正确使用沼气和“三沼”的综合利用。到2007年底，协会维修员已普查沼气用户60698户，发展会员1.5万人，维修沼气零散配件3.5万次，维修沼池1.5万余口，由于协会的专业服务扎实有序，解决了建池户的后顾之忧，从而缴发了农户积极参加建管安全使用沼气的热情。
四、通过土地转包流转形成规模经营已逐步成为郊县农村经营制度改革的一个亮点。党的十七届三中全会提出：要稳定和完善农村基本经营制度，意味着不仅现在土地承包关系要保持稳定并长久不变，还将赋予农民更加充分而有保障的土地承包经营权。我市农民已在稳定承包土地的基础上，坚持依法自愿有偿的原则，通过土地经营权有偿转包给龙头企业，让土地经营权流转，形成规模经营，既形成商品生产基地的规模，又保障了农民从土地转包中获得收益。公司又返聘农民在自己转包出去的土地上给公司打工，获得劳务收入，使农民的收入增加2—5倍，这种反租倒包形式，发挥了龙头企业在技术、资金管理上的优势，不仅为发展生态农业、商品农业、特色农业创造了条件，解决了农户单家独户经营形不成规模而又缺乏新技术和经营资金的难题，这种反租倒包的土地流转经营制度的改革，已逐步在我市郊县兴起，成为完善农村土地经营制度改革的一个亮点，实现了龙头企业和农民在经济效益上的双赢。
五、农民的生态农业意识在逐步增强。我市农民通过大力推广沼气池的修建和管护使用，广泛形成的猪一沼一粮（菜、果、药）农业生态模式，和其它多种形式的生态农业模式的成功实践，使广大农民在资源的节约、变废为宝的认识上有很大的提高，在推广乡村清洁工程和小流域治理等工程中，对环境友好型农业的生产对人居和生态环境的改善看到了光明的文明的前景。这些生态文明的理念，逐步被农民接受，并在一定程度上形成良好的习惯，为社会主义新农村的建设打下了良好的基础。广大农民生态农业意识的增强，大大提高了农民参与生态农业建设的积极性和主动性，逐步变上面要他们干为他们自己要求干，因此，我市广大农村将会像开阳县总结的那样：农村将“三废”（畜禽粪便，作物秸杆、生活垃圾和污水）变“三料”（肥料、燃料、饲料）形成“三益”（经济、生态和社会效益），以“三节”（节水、节肥、节能）促“三净”（净化水源、净化农田、净化庭院）做到“三化”（家居温暖清洁化、庭园经济高效化、农业生产无害化），实现“三生”（生产发展、生活富裕和生态文明）促进“三文”（生态文明、物质文明和精神文明）的大发展，带来社会主义新农村的新面貌。