所有与乙醇峰保留时间一致的物质都会影响乙醇的测定。应该通过提高乙醇与这些物质的分离度来减小这种干扰。
想要准确的测定乙醇的含量，就要把乙醇中可能含有的所有杂质峰都与乙醇峰尽量达到分离（分离度大于1.5）。而乙醇中具体会含有何种物质，应该参考乙醇的生产工艺来推断在生产过程中引入了何种物质，可能会生成何种物质等等。
那么想要使各种物质都与乙醇达到分离，就要通过调整色谱条件来做到。在不同的色谱条件下，同一物质的保留情况会发生变化。而当色谱条件变化时，不同物质的保留时间变化情况也是不一致的。也就是说，变化一个色谱条件，就会引起一系列连锁反应，导致各物质的相对保留时间出现变化，峰型也会有变化，直接影响就是各个峰之间出现分离度的变化。所以我们不能断言某种物质一定会干扰乙醇测定，因为这种物质在不同色谱条件下的与乙醇峰的分离度是不一样的。
以上所说的是用外标法测定含量。如果用面积归一化法来计算乙醇含量的话，就要考虑可能含有的杂质在该检测器下的响应值问题，因为某些物质在FID下响应值是很小的（四氯化碳，氯仿等等），这样的话，就无法得知该杂质的量，导致计算结果的不准确。就要更换检测器针对性的对该杂质进行定量检测，并在含量计算中进行扣除。同时也要注意各物质的分离度问题。