苯菌灵为内吸性杀菌剂，是植物体内代谢为多菌灵及另一种有挥发性异氰酸丁酯，是其主要杀菌物质。纯品为白色结晶，略有臭味。不溶于水，可溶于有机溶剂，在干燥状态 下稳定，遇潮湿会分解减效。对人畜低毒，对作物安全。
苯菌灵与多菌灵关系：
苯菌灵与多菌灵均属于苯并咪唑类杀菌剂，苯菌灵在作物体内很容易转化成多菌灵，但苯菌灵的防病效果并不与多菌灵相等同，对一些病害防治效果优于多菌灵，是因为苯菌灵的亲油性比多菌灵高，更容易渗入生物体内。
两种均为内吸性杀菌剂，具有向顶输导特性，对多种子囊菌和半知菌都有效，而对卵菌引起的病害无效。
实际应用中这两种最突出的问题就是易产生耐药性，一般连续应用3年以上效果即下降。解决的办法是与同两者相互负交替使用或混用。
苯菌灵与多菌灵两者的特点：
苯菌灵在作物体内很容易转化成多菌灵，因此一般认为苯菌灵进入作物体后，真正起杀菌作用的是多菌灵。但是，苯菌灵仍有其自己的杀菌活性，实际使用时，苯菌灵的防病效果并不与多菌灵相等，对某些病害的效果优于多菌灵。苯菌灵的亲油性比多菌灵强，更容易渗入植物体内。但多菌灵生产成本比苯菌灵低。